韦小宝(黄晓明 饰)和胡逸之结为兄弟。胡逸之向韦小宝要阿珂(应采儿 饰)，只因为了陈圆圆(宁静 饰)一病不起，要把阿珂带回云南。韦小宝对郑克塽(乔振宇 饰)一顿毒打出了气才放他走，和吴六奇在大江风浪之中唱起来了沉江。 韦小宝回京将云南吴三桂所作所为向康熙一一汇报，又把从云南押来的蒙古特使汗帖摩交给皇上，这一切也早在康熙掌握之中了。 双儿(何琢言 饰)成功帮韦小宝把八部四十二章经中的羊皮藏宝地图砌成，藏宝地点就在关外的鹿鼎山。双儿将满文分别印出，找笔帖式把满文译成汉字，韦小宝将这些秘密藏在心中，烧掉这些羊皮，以绝后患，害了康熙。 康熙借助外国人的科技，成功制造出大炮，并下令小宝歼灭神龙教。小宝知人善用，向康熙征用索额图(谭非翎 饰)向他推荐的施琅一起去攻打神龙岛。这一切都被跟随他的胖头陀和陆高轩(苏茂 饰)发现，二人赶赴神龙岛汇报。
